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崗位職責 一、單細胞測序數(shù)據(jù)分析 1、負責單細胞轉(zhuǎn)錄組（scRNA-seq）、空間轉(zhuǎn)錄組（spatial transcriptomics）、多組學整合數(shù)據(jù)的處理與分析，包括數(shù)據(jù)質(zhì)控（QC）、序列比對、基因表達定量、細胞聚類、差異表達分析及功能注釋。 2、構(gòu)建細胞類型注釋流程（如使用SingleR、CellID等工具），完成細胞亞群鑒定及細胞發(fā)育軌跡推斷（擬時序分析）。 3、開發(fā)定制化分析腳本（Python/R），支持個性化研究需求（如細胞互作網(wǎng)絡(luò)、細胞狀態(tài)轉(zhuǎn)換模型）。 4、 熟悉單細胞ATAC和免疫組庫（TCR/BCR）分析流程。 二、分析流程開發(fā)與優(yōu)化 1、搭建和維護單細胞測序分析標準化流程，整合開源工具。 2、 優(yōu)化算法參數(shù)，提升數(shù)據(jù)處理效率（如并行計算、云計算資源調(diào)度）。 三、生物信息學工具開發(fā) 1、開發(fā)自動化報告生成工具，實現(xiàn)分析結(jié)果可視化（R Shiny、Plotly、Dash）。 2、 構(gòu)建內(nèi)部數(shù)據(jù)庫，管理單細胞公共數(shù)據(jù)集（如HCA、Tabula Sapiens）及公司內(nèi)部實驗數(shù)據(jù)。 四、跨團隊協(xié)作 1、與實驗團隊合作設(shè)計測序方案，驗證生物信息學預(yù)測結(jié)果（如差異基因的qPCR驗證）。 2、為臨床或藥研團隊提供數(shù)據(jù)解讀支持，輸出可落地的生物學洞見。 任職要求 教育背景 生物信息學、計算生物學、統(tǒng)計學、計算機科學或相關(guān)領(lǐng)域本科及以上學歷（碩士優(yōu)先）。 技術(shù)能力 編程與工具： 精通Python和R語言，熟悉Linux環(huán)境及Shell腳本編程。 熟練使用單細胞分析工具（Seurat、Scanpy、Cell Ranger、STAR、Salmon）。 熟悉生物信息學數(shù)據(jù)庫（NCBI、ENA、Single Cell Portal）及常用算法（UMAP、t-SNE、WGCNA）。 數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗： 至少2年以上單細胞測序數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗，完整參與過至少1個單細胞項目（從原始數(shù)據(jù)到生物學結(jié)論）。 熟悉單細胞數(shù)據(jù)降噪、批次校正（Harmony、BBKNN）及細胞通訊分析（CellPhoneDB、CellChat）。 加分項： 有多組學（scRNA+ATAC/CITE-seq）整合分析經(jīng)驗。 熟悉云計算平臺（AWS、阿里云）及容器化技術(shù)（Docker/Singularity）。 有算法開發(fā)經(jīng)驗（如自定義聚類算法或軌跡推斷模型）。 其他要求 具備快速學習能力，能獨立跟蹤領(lǐng)域前沿技術(shù)（如空間多組學、機器學習驅(qū)動的細胞注釋）。 良好的跨學科溝通能力，能將復雜分析結(jié)果轉(zhuǎn)化為可理解的生物學結(jié)論。 英語熟練，能高效閱讀文獻及技術(shù)文檔。 優(yōu)先考慮條件 1、在國際期刊發(fā)表過單細胞相關(guān)論文。 2、有藥物研發(fā)背景（如腫瘤微環(huán)境解析、免疫細胞圖譜構(gòu)建）。 3、熟悉FDA/EMA的生物信息學數(shù)據(jù)提交規(guī)范（如FAIR原則）。