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南京大學(xué)現(xiàn)代生物研究院 韓瑞琦課題組 博士后招聘 研究院簡(jiǎn)介 南京大學(xué)現(xiàn)代生物研究院，簡(jiǎn)稱(chēng)"現(xiàn)代生物院"(Institute of Modern Biology, Nanjing University; IMB)，成立于2020年7月，位于六朝古都南京。現(xiàn)代生物院聚焦于創(chuàng)新型生物醫(yī)學(xué)前沿基礎(chǔ)研究，鼓勵(lì)和支持開(kāi)拓性、系統(tǒng)性的科學(xué)探索，致力成為擁有一批國(guó)際公認(rèn)學(xué)術(shù)權(quán)威和"學(xué)者型研究環(huán)境"的國(guó)際一流生物醫(yī)學(xué)研究中心。 實(shí)驗(yàn)室課題組簡(jiǎn)介 韓瑞琦教授，2007-2011年在荷蘭奈梅亨獲得生命科學(xué)本科學(xué)位，隨后于2011-2013年在荷蘭阿姆斯特丹攻讀癌癥學(xué)碩士。2013年加入荷蘭癌癥研究所Reuven Agami院士團(tuán)隊(duì)從事基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控與蛋白質(zhì)翻譯效率之間系統(tǒng)性關(guān)聯(lián)的博士研究，在此期間首次開(kāi)發(fā)了針對(duì)非編碼基因組及增強(qiáng)子的CRISPR篩選方法。2019年加入荷蘭皇家科學(xué)院發(fā)育生物學(xué)與干細(xì)胞研究所從事三維基因組調(diào)控及黏連蛋白相關(guān)的博士后研究。其研究成果發(fā)表于Cell， Nature biotechnology，Molecular cell，Genome biology等國(guó)際期刊。 2025年加盟南京大學(xué)現(xiàn)代生物研究院，建立基因組結(jié)構(gòu)調(diào)控實(shí)驗(yàn)室。 韓瑞琦教授長(zhǎng)期致力于探究表觀(guān)遺傳對(duì)基因轉(zhuǎn)錄及細(xì)胞功能的影響。在相關(guān)領(lǐng)域取得了一系列原創(chuàng)性成果。1. 首次通過(guò)系統(tǒng)性的研究來(lái)揭示在細(xì)胞中基因轉(zhuǎn)錄過(guò)程與蛋白質(zhì)翻譯效率之間的直接關(guān)系，并通過(guò)m6A相關(guān)的RNA修飾來(lái)解釋了其中的關(guān)鍵機(jī)制（Cell, 2017）。2. 建立了首個(gè)針對(duì)非編碼基因組的CRISPR文庫(kù)來(lái)對(duì)人類(lèi)基因組的增強(qiáng)子區(qū)域進(jìn)行功能性篩選，并發(fā)現(xiàn)了數(shù)個(gè)具有顯著細(xì)胞功能的增強(qiáng)子 （Nature biotechnology, 2016; Genome biology 2018）。3. 首次在細(xì)胞中開(kāi)發(fā)了黏連蛋白定向裝載并可實(shí)現(xiàn)正常蛋白功能的工具，同時(shí)揭示了若干黏連蛋白關(guān)鍵功能的原創(chuàng)研究 （Manuscript in revision, 2023）。 代表性論文 1. Ruiqi Han#*, Yike Huang#, Iwan Vaandrager, Amin Allahyar, Mikhail Magnitov, Marjon Verstegen, Elzo de Wit, Peter H. L. Krijger, Wouter de Laat*. Targeted cohesin loading characterizes the entry and exit sites of loop extrusion trajectories. (Manuscript in revision) 2. Boris Slobodin#*, Ruiqi Han#, Vittorio Calderone, Joachim AF Oude Vrielink, Fabricio Loayza-Puch, Ran Elkon, Reuven Agami*. Transcription impacts the efficiency of mRNA translation via co-transcriptional N6-adenosine methylation. Cell 169(2): 326-337. (2017) 3. Ruiqi Han#, Li Li#, Alejandro Pi?eiro Ugalde, Arieh Tal, Zohar Manber, Eric Pinto Barbera, Veronica Della Chiara, Ran Elkon, Reuven Agami. Functional CRISPR screen identifies AP1-associated enhancer regulating FOXF1 to modulate oncogene-induced senescence. Genome biology 19: 118. (2018) 4. Gozde Korkmaz#, Rui Lopes#, Alejandro P Ugalde, Ekaterina Nevedomskaya, Ruiqi Han, Ksenia Myacheva, Wilbert Zwart, Ran Elkon, Reuven Agami*. Functional genetic screens for enhancer elements in the human genome using CRISPR-Cas9. Nature Biotechnology 34(2): 192-198. (2016) 5. Niels J. Rinzema, Konstantinos Sofiadis, Sjoerd J. D. Tjalsma, Marjon J. A. M. Verstegen, Yuva Oz, Christian Valdes-Quezada, Anna-Karina Felder, Teodora Filipovska, Stefan van der Elst, Zaria de Andrade dos Ramos, Ruiqi Han, Peter H. L. Krijger, Wouter de Laat*. Building regulatory landscapes reveals that an enhancer can recruit cohesin to create contact domains, engage CTCF sites and activate distant genes. Nature Structural & Molecular Biology 29(6): 563-574. (2022) 6. Li Li, Alejandro P Ugalde, Colinda LGJ Scheele, Sebastian M Dieter, Remco Nagel, Jin Ma, Abhijeet Pataskar, Gozde Korkmaz, Ran Elkon, Miao-Ping Chien, Li You, Pin-Rui Su, Onno B Bleijerveld, Maarten Altelaar, Lyubomir Momchev, Zohar Manber, Ruiqi Han, Pieter C Van Breugel, Rui Lopes, Peter Ten Dijke, Jacco van Rheenen, Reuven Agami*. A comprehensive enhancer screen identifies TRAM2 as a key and novel mediator of YAP oncogenesis. Genome biology 22(1): 1-28. (2021) 7. Boris Slobodin, Anat Bahat, Urmila Sehrawat, Shirly Becker-Herman, Binyamin Zuckerman, Amanda N. Weiss, Ruiqi Han, Ran Elkon, Reuven Agami, Igor Ulitsky, Idit Shachar, Rivka Dikstein*. Transcription Dynamics Regulate Poly(A) Tails and Expression of the RNA Degradation Machinery to Balance mRNA Levels. Molecular Cell 78(3):434-444. (2020) 8. Li Li, Pieter C van Breugel, Fabricio Loayza-Puch, Alejandro P Ugalde, Gozde Korkmaz, Naama Messika-Gold, Ruiqi Han, Rui Lopes, Eric P Barbera, Hans Teunissen, Elzo de Wit, Ricardo J Soares, Boye S Nielsen, Kim Holmstr?m, Dannys J Martínez-Herrera, Maite Huarte, Annita Louloupi, Jarno Drost, Ran Elkon, Reuven Agami*. LncRNA-OIS1 regulates DPP4 activation to modulate senescence induced by RAS. Nucleic Acids Research gky087, https://doi.org/10.1093/nar/gky087. (2018) 9. Jianhui Sun, Remco Nagel, Esther A Zaal, Alejandro Pi?eiro Ugalde, Ruiqi Han, Natalie Proost, Ji-Ying Song, Abhijeet Pataskar, Artur Burylo, Haigen Fu, Gerrit J Poelarends, Marieke van de Ven, Olaf van Tellingen, Celia R Berkers & Reuven Agami*. SLC1A3 contributes to L-asparaginase resistance in solid tumors. The EMBO Journal 38(21). (2019) 10. Ruiqi Han, Boris Slobodin, Reuven Agami. The Methylated way to translation. Oncotarget 8(55): 93313-14. (2017) 11.Florie Borel, Ruiqi Han, Allerdien Visser, Harald Petry, Sander J.H. van Deventer, Peter L.M. Jansen, Pavlina Konstantinova, with collaboration of the Réseau Centre de Ressources Biologiques Foie (French Liver Biobanks Network), France. Adenosine triphosphate‐binding cassette transporter genes up‐regulation in untreated hepatocellular carcinoma is mediated by cellular microRNAs. Hepatology 55: 821–832. doi:10.1002/hep.24682. (2012) 招聘崗位：博士后科研人員 一、崗位要求 1、博士后應(yīng)聘者應(yīng)在表觀(guān)遺傳研究方向，分子細(xì)胞生物學(xué)等相關(guān)領(lǐng)域已取得或即將取得博士學(xué)位，具有表觀(guān)遺傳學(xué)等研究背景；博士期間受過(guò)良好的科研訓(xùn)練，以第一作者身份在國(guó)際重要刊物上發(fā)表領(lǐng)域內(nèi)有影響力的論文。 2、有科研熱情，具有獨(dú)立開(kāi)展科研課題的能力和良好的實(shí)驗(yàn)操作能力；具有較好的英文閱讀和寫(xiě)作能力； 3、具有獨(dú)立申請(qǐng)基金的能力，并參與實(shí)驗(yàn)室的項(xiàng)目申請(qǐng)； 4、善于交流和溝通，富有團(tuán)隊(duì)合作精神。 二、崗位待遇 1、工資待遇：有競(jìng)爭(zhēng)力的年薪，積極支持并推薦申請(qǐng)各種基金與博士后項(xiàng)目，特別優(yōu)秀者一事一議；優(yōu)先支持申報(bào)南京大學(xué)2025年度“毓秀青年學(xué)者計(jì)劃”，入選者年收入可達(dá)30萬(wàn)以上。 2、所聘人員的人事、工資、保險(xiǎn)、福利等參照國(guó)家對(duì)事業(yè)單位的相關(guān)規(guī)定，以及南京大學(xué)的相關(guān)規(guī)章制度執(zhí)行； 3、博后/專(zhuān)職科研系列公寓，住房補(bǔ)貼； 4、享受學(xué)校同等職工福利待遇。 三、申請(qǐng)方式 請(qǐng)應(yīng)聘者將個(gè)人簡(jiǎn)歷，簡(jiǎn)要的未來(lái)研究計(jì)劃或方向，發(fā)表的文章及相關(guān)學(xué)歷學(xué)位證明材料等合并成一個(gè)PDF文件形式發(fā)送至***************。格式"姓名-博士后申請(qǐng)"。另請(qǐng)至少提供兩封推薦信（≥2），由推薦人直接投遞至***************。應(yīng)聘材料將予以嚴(yán)格保密，不予退還。通過(guò)初審者，我們會(huì)盡快安排面試。期待您的加盟！